Corona mutanti, kteří nám chtějí zkazit rok 2021 (COVID-19)

Právě když jsme si mysleli, že bude rok 2021 rok zotavení z pandemické krize se zdá, že skutečný boj začíná COVID 19 a jeho mutace právě začal.

Rok 2020 předpovídali dlouhou a spíše temnou zimu. Ale bohužel tento nyní vypadá ještě ponuřeji, než jsme si původně mysleli. Stejně jako první vakcíny proti koronaviru ukázaly světlo na konci tunelu a svým způsobem ohlašovaly konec pandemii COVID-19, na druhou stranu existují nové "verze" viru COVID 19 se staly rostoucím problémem, protože byly zjištěny ve více než 40 zemích, včetně Slovinsko. Takzvaná „skotská“ mutace a virus z Jižní Afriky však staví svět před nové výzvy a staví před vědce několik odborných dilemat, která jsou mimořádně znepokojivá.

Agresivita šíření tyto nové mutace je šokující, protože během několika týdnů byly některé oblasti světa nahrazeny běžnými variantami viru. Skotská mutace v některých zemích však počet nových infekcí již raketově vzrostl. Je to dobrý příklad Spojené království, kde se virus stal dominantním za něco málo přes dva měsíce (říjen – prosinec). Právě z tohoto důvodu byla okamžitě nutná nová a přísná opatření a omezení, jejichž uvolnění není v dohledu.

Mutace proto se šíří po celém světě nezastavitelnou rychlostí a zároveň se stávají dominantním „kmenem“ či verzí viru. PROTI minulý čtvrtek Ředitel Světové zdravotnické organizace tento týden vyzval starý kontinent (Evropa), aby přijal naléhavá opatření ke kontrole koronaviru a okamžitě zavedl ještě přísnější opatření. Zároveň je vyzval, aby zrychlili DNA analýza kmenů viru mezi testovanou populací.

Všechny viry mutují, jak se pohybují populací, a mutace jsou zcela přirozené a samozřejmé. V případě SARS-CoV-2 až donedávna nezpůsobovaly velké obavy. Ale virus se značkou B.1.1.7 (Velká Británie) a štítek 501Y.V2 (Jižní Afrika) mají překvapivě mnoho změn v proteinové části viru, která zapadá do receptoru v lidských buňkách, který umožňuje viru infikovat.

Díky těmto změnám jsou nové verze nakažlivější – než již předchozí verze nadprůměrně nakažlivý virus. I když neexistují důkazy o tom, že způsobují závažnější onemocnění, více případů rozhodně znamená větší zátěž pro zdravotnická zařízení a následně i zvyšující se úmrtnost. Pro Slovinsko by to bylo nekontrolovatelné nárůst infekcí může být tragické, protože systém již pracuje na horní hranici své kapacity.

Někteří výzkumníci jsou hlasití ohledně skutečnosti, že mutace by se mohly vyhnout aktuálně dostupným vakcínám. Lékaři, virologové a další výzkumníci proto nabádají úředníky k očkování 24 hodin denně, 7 dní v týdnu, jako by šlo o bezprecedentní nouzovou situaci. Výrobci vakcín jsou vyzýváni, aby urychleně rozšířili výrobní kapacity vakcín. Jen tak můžeme skutečně omezit šíření viru, a tím automaticky omezit možnost mutací viru. Klíčové bude očkování populace, protože se nám krátí čas.

Vědci z Jižní Afriky poznamenávají, že verze, která se tam objevila, je cca O 50 procent přenosnější, a že varianta viru ze Spojeného království je O 70 procent přenosnější od běžného SARS-CoV-2, který dosud převládal.

Zatímco výrobci vakcín jako např Pfizer tvrdí, že jejich technologie se snadno přizpůsobují změnám ve viru, stále přesně nevíme, jak budou stávající verze vakcín proti novým mutacím fungovat. A jak se virus šíří dál a zjevně mnohem rychleji s novými variantami, zvyšuje se pravděpodobnost nebezpečnějších mutací.

Jednoduše řečeno: čím více virů v ekosystému, tím statisticky větší šance na mutace. Nové varianty viru a budoucí mutace těchto variant tak mohou ohrozit stávající vakcíny a předznamenat novou, potenciálně ještě obtížnější kapitolu pandemie.

Protože pokud budou vakcíny proti novým kmenům viru neúspěšné, bude nutné přeočkovat všechny již očkované. To prakticky znamená, že jsme na začátku a ne na konci boje, jak mnozí očekávali. I proto mnozí odborníci varují, že je potřeba co nejvíce a tímto způsobem omezit kontakty“udusit se” virus co nejvíce. Mnozí už v tichosti mluví o přísném globálním „uzamčení“, které by bylo v tuto chvíli nejúčinnější zbraní. Stejně jako Čína. Protože jedině strategie Číňanů, kteří kvůli pár případům kompletně izolují celé oblasti, je ta, která může přinést výsledky a velmi rychlé zlepšení.

Proč jsou nové varianty COVID-19 tak znepokojivé

Vědci už varují dlouho, že účinnost vakcín klesá s mutacemi viru. S virem SARS-CoV-2 jsou hlavní mutace, které vědcům způsobují bolesti hlavy, proteiny viru, tedy části, která mu umožňuje vstoupit do lidských buněk. Je to také protein, pro který jsou naše stávající vakcíny určeny COVID 19, které jsou aktuálně k dispozici. Dosud jich bylo více, než bylo identifikováno 4000 mutací viru, ale většina nezměnila funkci viru a nezpůsobila zbytečné obavy.

Ve vzácných případech může mutace způsobit změny, které viru poskytnou výhodu a nějakým způsobem jej vylepší. To je přesně to, co se děje s výše uvedenými mutacemi. I kvůli množství viru v „systému“ a zcela statistické možnosti, že se to stane.

Varianta B.1.1.7 ve Velké Británii obsahuje 23 mutací v genomu virus, zatímco jihoafrická varianta má 501Y.V2 alespoň 21 mutací, z nichž některé se překrývají. V obou případech se zdá, že změny zvýšily schopnost viru reprodukovat se.

V případě jihoafrické verze vědci opakovaně poukazují na mutaci E484K v receptorové vazebné doméně viru, kde se váže na lidské buňky.

„Ta mutace byla prokázána E484K snižuje rozpoznávání protilátek,“ řekl Francois Balloux, profesor počítačové biologie systémů na University College London. To znamená, že může pomoci viru „obejít imunitní ochranu poskytovanou předchozí infekcí nebo očkováním“.

12,535 #SARSCoV2 genomy byly nahrány do databáze GISAID včera (dvanáct tisíc pět set třicet pět za jediný den!!!). Z těchto čísel se mi točí hlava a nejsem si jistý, že naše výpočetní infrastruktura bude tímto tempem fungovat velmi dlouho 😬. pic.twitter.com/0OCWQqzing

— Prof Francois Balloux (@BallouxFrancois) 15. ledna 2021

Výzkumníci proto prokázali, jak k tomu může dojít v buněčné kultuře, ale většina těchto studií dosud nebyla recenzována. V praxi to zjednodušili“in vitro” experiment a jsou virem s mutací E484K vystavena plazmě od pacientů, kteří již překonali obvyklé COVID 19. Zpočátku se zdálo, že protilátky porazí virus. Brzy zjistili, že plazma nemá na tento typ viru žádný zvláštní účinek, a to i přes přítomnost protilátek.

Autor studie Rino Rappuoli, profesor výzkumu vakcín na Imperial College a hlavní vědec farmaceutické společnosti GSK, řekl, že když on a jeho kolegové poprvé provedli experiment, netušili, jak důležité budou jejich zjištění, protože se odrazí v reálném životě. To, co vědci pozorovali „in vitro“, se stává součástí reality. Farmaceutická společnost GSK, která má i vakcínu pro COVID 19 tak už přemýšlí o úpravě vakcíny.

K podobným závěrům dochází i řada dalších vědců. Konkrétně sledovali, jak mutace změnily účinnost protilátkové odpovědi u lidí, kteří již virus měli. Zjistili také, že měl E484K schopnost únikové protilátky. Studie z Jižní Afriky zahrnující plazmu od dárců, kteří překonali normu COVID 19, ukázaly, že protilátky z předchozí infekce byly proti nové variantě zcela neúčinné asi u poloviny dárců.

Tady si ale musíte dávat pozor! To je asi studia přežití pacientů s COVID-19 a ne těch, kteří dostali vakcínu. Prozatím se přesně neví, jak budou reagovat lidé v klinických studiích, kteří již vakcínu dostali.

Přesto Rappuoli řekl, že zjištění jsou extrémně znepokojivá. "Pokud dáme viru příliš mnoho času pod imunitním tlakem, může tento virus uniknout."

To se zapíše do historie jako jeden z největších úspěchů vědy a lékařského výzkumu. Možná nejpůsobivější.
Dal jsem dohromady předběžnou časovou osu některých klíčových milníků, abych ukázal, jak bylo několik let práce stlačeno do měsíců. pic.twitter.com/BPcaZwDFkl

See also

Zdraví

Proč nás slunce vyčerpává? Příčiny a řešení letní únavy

— Eric Topol (@EricTopol) 28. listopadu 2020

Závod s časem

Výrobci vakcín jako např Pfizer a AstraZeneca poukazují na to, že podle prvních rozborů jejich vakcíny úspěšně fungují proti novým verzím. Zjistili tedy, že vakcína je účinná proti mutaci B.1.1.7, díky čemuž je nepravděpodobné, že by tato mutace z vakcíny unikla. Pokud by se objevila varianta odolná vůči vakcíně, generální ředitel BioNTech Ugur Sahin řekl médiím, že nová vakcína by mohla být vyrobena za pouhých šest týdnů. Totiž, výhodou nových vakcín je, že se musí změnit pouze vývojáři vakcín DNA nebo mRNA (informace o RNA), aby přizpůsobili vakcínu, což mohou v případě potřeby provést rychle a snadno.

A co je nejdůležitější, tyto nové vakcíny by nevyžadovaly revalidaci a rozsáhlé klinické zkoušky ze strany regulačních institucí. Schvalovací proces by však byl velmi podobný schvalování vakcín proti sezónní chřipce.

Přes vše výše uvedené všichni vědci zdůrazňují, že jsme v závodu s časem a že musíme extrémně rychle reagovat a virus omezit.

Co nás čeká v roce 2021?

Abychom virus porazili včas, tedy dříve, než se vymkne kontrole, je úkolem každého jednotlivce co nejvíce omezuje virus a starat se zabránění šíření viru. Ve skutečnosti je většina virologů extrémně znepokojena, ale nechce vyvolat žádnou paniku, i když je to v tuto chvíli klíčové, protože statistická možnost vývoje mutace viru SARS-CoV-2, která by mohla mít mnohem více závažný průběh onemocnění, než je ten stávající, se každým dnem zvyšuje.

Vědci a zdravotníci proto doufají, že počet případů sníží a rychle přibudou stádní imunita stávajícími vakcínami, ale zároveň se připraví na změny viru, které mohou očekávat.

Na vysledovali mutace a pochopit, jak mohou ovlivnit účinnost vakcíny, musí vlády více investovat do genomového sekvenování, řekl Dr. Lessells. Toho posledního se dělá příliš málo, také kvůli náročnému procesu určování typu viru. Podle Dr Lessells přibližně 10 procent případů je sekvenováno ve Spojeném království, což je celosvětově nejvyšší úroveň sekvenování. Mnoho zemí analyzuje pouze o něco více než procento testů.

Existuje však zcela jiný způsob, jak zabránit výskytu nebezpečných mutací: zabránit výskytu případů v první řadě nošením masek, sociálním distancováním, rychlým testováním a léčbou a izolací nakažených lidí. Virus nemůže mutovat, pokud se nerozmnoží a nerozšíří se v populaci.

Pro tuto chvíli je výskyt znepokojivých mutací připomínkou toho, že máme před sebou ještě dlouhou cestu navzdory naší kolektivní únavě, řekl Dr Lessells.

A co Slovinsko?

PROTI Slovinsko již jsme objevili tzv.skotský” mutace, ale není známo, jaké množství vzorků ve skutečnosti analyzujeme. Vzhledem k tomu, že se virus vyskytuje prakticky ve všech sousedních zemích, musíme si položit otázku, zda máme my Slovinci opravdu takové štěstí, že nás tento dominantní kmen vyprostil ze spárů a zdánlivě jsme stále v bezpečí. Statisticky vzato vše mluví proti této skutečnosti. A tento virus je zde samozřejmě také přítomen. Zatímco v Bavorsku zavádějí přísná opatření, která zahrnují nosí masku N95 v uzavřená veřejná prostranství a MHD, ve Slovinsku uvažujeme o otevření školek a škol, a to i přesto, že přítomnost viru v systému je opravdu velká a velmi znepokojující a že podle „vládního“ semaforu jsme opravdu jen jedni krok pryč z "černé" fáze.

Mnoho vědců varuježe tento druh otevření života by mohl znamenat možnost, aby virus prošel dalšími mutacemi a stal se nebezpečnějším, a především rezistentní na vakcínu. Všichni volají po větších investicích do rozborů odpadních vod, které jsou jedním z lepších indikátorů přítomnosti viru v populaci. Většina vědců souhlasí s tím, že kvůli větší virulenci nového kmene musí vstoupit v platnost nová, přísnější pravidla sociálního distancování a že musíme začít používat lepší ochranu – tedy masky N95 na všech veřejných prostranstvích. Všichni ale zastávají názor, že by se mělo co nejrychleji očkovat co nejvíce lidí. Protože pouze imunita stáda může zabránit šíření viru a jeho schopnost měnit se s množstvím přenosů.

Když se zdálo rok 2021 rok zotavení z pandemie, podle všech ukazatelů začíná rok, kdy skutečně zahájíme boj s tímto neviditelným nepřítelem. Hlavními složkami jsou čas a statistiky, které bohužel nejsou na naší straně. I proto je právě teď důležitá rozhodná akce a boj každého jednotlivce! Jen společně můžeme zachovat svět, jak jsme ho znali.